Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20518E9Q548 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm20518E9Q548 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20518E9Q548 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms