Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b2E9Q3E1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Aldh3b2E9Q3E1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Aldh3b2E9Q3E1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms