Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp944E9PUS4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp944E9PUS4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms