Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Soga1E1U8D0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Soga1E1U8D0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Soga1E1U8D0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms