Protein–RNA interactions for Protein: D3YYU8

Obsl1, Obscurin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obsl1D3YYU8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Obsl1D3YYU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Obsl1D3YYU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Obsl1D3YYU8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms