Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Brpf1B2RRD7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brpf1B2RRD7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms