Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp42B2RQC2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp42B2RQC2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms