Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prr29B1ARI9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr29B1ARI9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.3 ms