Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pm20d2A3KG59 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms