Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms