Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trbv30A0A0B4J1P1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trbv30A0A0B4J1P1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trbv30A0A0B4J1P1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trbv30A0A0B4J1P1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trbv30A0A0B4J1P1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trbv30A0A0B4J1P1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trbv30A0A0B4J1P1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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