Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1700019A02RikA0A087WPV9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms