Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knop1Q9Z2Q2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms