Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme3Q9WV85 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme3Q9WV85 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms