Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apobec2Q9WV35 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms