Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stub1Q9WUD1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stub1Q9WUD1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms