Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hic1Q9R1Y5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hic1Q9R1Y5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hic1Q9R1Y5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms