Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cry2Q9R194 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cry2Q9R194 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cry2Q9R194 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms