Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc3Q9QZC1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc3Q9QZC1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc3Q9QZC1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms