Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SpastQ9QYY8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SpastQ9QYY8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms