Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hacd1Q9QY80 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hacd1Q9QY80 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hacd1Q9QY80 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms