Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dkk3Q9QUN9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms