Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf19Q9JLL3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf19Q9JLL3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms