Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx20Q9JJY4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx20Q9JJY4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx20Q9JJY4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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