Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl28Q9JIL2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms