Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dkc1Q9ESX5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkc1Q9ESX5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dkc1Q9ESX5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms