Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mkrn2Q9ERV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mkrn2Q9ERV1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mkrn2Q9ERV1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms