Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SgshQ9EQ08 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SgshQ9EQ08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SgshQ9EQ08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms