Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr6Q9EPW9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr6Q9EPW9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr6Q9EPW9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr6Q9EPW9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms