Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlr1Q9EPQ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr1Q9EPQ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr1Q9EPQ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms