Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a1Q9EPE9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a1Q9EPE9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a1Q9EPE9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms