Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mlst8Q9DCJ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mlst8Q9DCJ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms