Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xab2Q9DCD2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xab2Q9DCD2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms