Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubiad1Q9DC60 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubiad1Q9DC60 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubiad1Q9DC60 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubiad1Q9DC60 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubiad1Q9DC60 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubiad1Q9DC60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubiad1Q9DC60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubiad1Q9DC60 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubiad1Q9DC60 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubiad1Q9DC60 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms