Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim23Q9DAL0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms