Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sgf29Q9DA08 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sgf29Q9DA08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sgf29Q9DA08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms