Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh4Q9D8F1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms