Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kctd4Q9D7X1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Kctd4Q9D7X1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kctd4Q9D7X1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms