Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Speer4f1Q9D5Q6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Speer4f1Q9D5Q6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms