Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930513O06RikQ9D549 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930513O06RikQ9D549 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930513O06RikQ9D549 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms