Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf1dQ9D4V4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Taf1dQ9D4V4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms