Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc105Q9D4K7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms