Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Efhd1Q9D4J1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efhd1Q9D4J1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms