Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chordc1Q9D1P4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chordc1Q9D1P4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chordc1Q9D1P4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms