Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9D1F3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1F3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D1F3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D1F3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D1F3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D1F3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D1F3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D1F3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D1F3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D1F3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D1F3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D1F3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D1F3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D1F3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q9D1F3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D1F3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D1F3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D1F3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms