Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR8

Tsfm, Elongation factor Ts, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsfmQ9CZR8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TsfmQ9CZR8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TsfmQ9CZR8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms