Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrtapQ9CYD3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrtapQ9CYD3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrtapQ9CYD3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms