Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d3Q9CSV6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms