Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc96Q9CR92 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc96Q9CR92 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms