Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd1Q9CR42 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd1Q9CR42 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd1Q9CR42 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd1Q9CR42 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd1Q9CR42 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd1Q9CR42 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd1Q9CR42 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd1Q9CR42 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms